AT3G15352.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cytochrome c oxidase 17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes protein similar to yeast COX17, a copper-binding protein that mediates the delivery of Cu to the mitochondria for the assembly of a functional cytochrome oxidase complex. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cytochrome c oxidase 17 (COX17); FUNCTIONS IN: copper chaperone activity; INVOLVED IN: response to bacterium, response to copper ion; LOCATED IN: mitochondrial intermembrane space; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome c oxidase copper chaperone (InterPro:IPR007745); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Cytochrome C oxidase copper chaperone (COX17) (TAIR:AT1G53030.1); Has 294 Blast hits to 294 proteins in 132 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 138; Fungi - 51; Plants - 55; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 50 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:5180266..5180490 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 8051.65 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.78 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.57 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 74 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
1: MTDQPAQNGL IPPPTSEPSK AAASAETKPK KRICCACPDT KKLRDECIVE HGESACTKWI EAHKICLRAE GFNV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)