AT3G09920.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.949 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : phosphatidyl inositol monophosphate 5 kinase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
phosphatidyl inositol monophosphate 5 kinase (PIP5K9); FUNCTIONS IN: 1-phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase activity, phosphatidylinositol phosphate kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: carbohydrate metabolic process, cellular amino acid metabolic process; LOCATED IN: cytosol, nucleus, membrane; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase, core, subgroup (InterPro:IPR016034), Phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase, plant (InterPro:IPR017163), MORN motif (InterPro:IPR003409), Phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase, core (InterPro:IPR002498); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase family protein (TAIR:AT1G60890.1); Has 25974 Blast hits to 7709 proteins in 605 species: Archae - 0; Bacteria - 3692; Metazoa - 3999; Fungi - 475; Plants - 1866; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 15942 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:3040426..3043676 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 92097.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.54 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.45 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 815 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSGLDVRGAV SFAERTKSVD ALTKKEILSA LNSGEVSETS EDARFRVREL VLPDGESYSG SLLGNVPEGP GKYIWSDGCV YDGEWRRGMR HGIGNMRWAS 101: GASYDGEFSG GYMHGSGTYV DANKLTYKGR WRLNLKHGLG YQVYPNGDVF EGSWIQGLGE GPGKYTWANK NVYLGDMKGG KMSGKGTLTW VTGDSYEGSW 201: LNGMMHGVGV YTWSDGGCYV GTWTRGLKDG KGSFYSAGTR VPVVQEFYLN ALRKRGVLPD MRRQNQVASS VNMENLRVGV NRNKLSKGSL INLEQSRNGR 301: VSLERRWSLE VSIEKVIGHG YSDLSTAVLD SGSSVQYKAN IPILEREYMQ GVLISELVVN NGFSRTSRRA KRKHKRLVKE AKKPGEVVIK GHRSYDLMLS 401: LQLGIRYTVG KITPIQRRQV RTADFGPRAS FWMTFPRAGS TMTPPHHSED FKWKDYCPMV FRNLREMFKI DAADYMMSIC GNDTLRELSS PGKSGSVFFL 501: SQDDRFMIKT LRKSEVKVLL RMLPDYHHHV KTYENTLITK FFGLHRIKPS SGQKFRFVVM GNMFFTDLRI HRRFDLKGSS LGRSADKVEI DENTILKDLD 601: LNYSFFLETS WREGLLRQLE IDSKFLEAQN IMDYSLLLGV HHRAPQHLRS QLVRSQSITT DALESVAEDD TIEDDMLSYH EGLVLVPRGS ENTVTGPHIR 701: GSRLRASAVG DEEVDLLLPG TARLQIQQGV NMPARAELIP GREDKEKQIL HDCCDVVLYL GIIDILQEYN MTKKIEHAYK SLHFDSLSIS AVDPTFYSQR 801: FLEFIKKVFP QNNKS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)