AT3G09890.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.913 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Ankyrin repeat family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Ankyrin repeat family protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ankyrin repeat-containing domain (InterPro:IPR020683), Ankyrin repeat (InterPro:IPR002110); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Ankyrin repeat family protein (TAIR:AT4G19150.1); Has 59827 Blast hits to 23926 proteins in 1138 species: Archae - 66; Bacteria - 4314; Metazoa - 34126; Fungi - 4602; Plants - 2722; Viruses - 531; Other Eukaryotes - 13466 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:3032678..3034158 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 22106.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 206 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAVPRGGNGL NEEEDVDGEN AIFEENGVDY DTDSELPSHL RDLAAAAQAG DVAALRTAID NLNGRVDEPL EDNDSALHLA CLYGHLPCVQ LLLERGADME 101: VKDEDEAIPL HDACAGGYLE IVQLLFSRAS SPECVKRMIE TADIEGDTPL HHAARGEHVD VVRFLLGSGA SPTTQNSYGK TPGELADLNT DAKRILEEAI 201: NNSMIS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)