AT3G03070.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : NADH-ubiquinone oxidoreductase-related | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
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Computational Description (TAIR10) |
NADH-ubiquinone oxidoreductase-related; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Zinc finger, CHCC-type (InterPro:IPR019401), NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), iron-sulphur protein 6, mitochondria (InterPro:IPR016668); Has 288 Blast hits to 288 proteins in 139 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 142; Fungi - 84; Plants - 40; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 20 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr3:-:696593..698069 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 12234.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 7.51 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 110 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASNLLKALI RSQILPSSRR NFSVATTQLG IPTDDLVGNH TAKWMQDRSK KSPMELISEV PPIKVDGRIV ACEGDTNPAL GHPIEFICLD LNEPAICKYC 101: GLRYVQDHHH |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)