AT2G47830.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Cation efflux family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Cation efflux family protein; FUNCTIONS IN: cation transmembrane transporter activity, efflux transmembrane transporter activity; INVOLVED IN: cation transport, transmembrane transport; LOCATED IN: membrane; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cation efflux protein (InterPro:IPR002524); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Cation efflux family protein (TAIR:AT3G58060.1); Has 9484 Blast hits to 9472 proteins in 2416 species: Archae - 234; Bacteria - 7791; Metazoa - 296; Fungi - 408; Plants - 276; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 479 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:19591094..19593973 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 51029.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.62 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 471 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGIIRFQILN PTRICRSTIY YMSCRYLPSS SSSSSPLRVS SSSSQKPSFD FSRRWHFGHP DHHQQYQKPG EEGEKIFRLG LTADIGLSVA KALTGYLCGS 101: TAIIADAAHS VSDVVLSGVA LVSYRAANVP KDKEHPYGHG KFETLGALGI SAMLLATGSG IAWHALDLLS IALSAAPEVI HSGHHHGIDM NHPILALTVT 201: IASISIKEGL YWITKRAGEK QGSGLMMANA WHHRSDAISS LVALVGVGGS ILGVNFLDPL AGLVVSTMIV NAGLKTGHQS ILELVDAAIP AQQLEPIRQT 301: ILQVEGVKGC HRLRGRRAGS SLYLDVHIVV DPFSSVSVAH EVGEYVRRQI NLNHPEVSEV FIHIDPAFLQ FSCSTKDHDS ITKESNICQE IKHVEATVSD 401: IFSSQLSEKL TIKRITPHLL HSKILLQIVV AMPSTMSIQD VMIAAEHAEK EILKAAPNVA RVSIQLSLNS E |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)