AT2G46580.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.860 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein; FUNCTIONS IN: FMN binding, pyridoxamine-phosphate oxidase activity; INVOLVED IN: oxidation reduction, pyridoxine biosynthetic process; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase (InterPro:IPR000659), FMN-binding split barrel (InterPro:IPR012349), Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-like, FMN-binding domain (InterPro:IPR011576), FMN-binding split barrel, related (InterPro:IPR009002); Has 1290 Blast hits to 1290 proteins in 309 species: Archae - 0; Bacteria - 510; Metazoa - 56; Fungi - 60; Plants - 40; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 624 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:19129409..19130513 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 22620.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.37 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.56 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 198 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGTHVAPWKQ LLFGAIEANS HLSHSSYVQL ATIGLNGRPS NRTVVFRGFE ENSDRIQINT DLRSRKIEEL KHCPFSEMCW YFSDTWEQFR INGRIEVIDA 101: SNPDQTKLQQ REKAWFANSL RSRLIYVCPT PGSPCNSEQS SQQVKLDPSS GPVPEYCLLL LEPEKVDYLN LKTNQRLFFS SMATGTGEKC WTSEKVNP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)