AT1G49880.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 0.645 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Erv1/Alr family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Erv1/Alr family protein; FUNCTIONS IN: thiol oxidase activity; INVOLVED IN: oxidation reduction; EXPRESSED IN: 15 plant structures; EXPRESSED DURING: 7 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ERV/ALR sulphydryl oxidase (InterPro:IPR017905), Erv1/Alr (InterPro:IPR006863); Has 843 Blast hits to 843 proteins in 218 species: Archae - 0; Bacteria - 1; Metazoa - 134; Fungi - 258; Plants - 61; Viruses - 64; Other Eukaryotes - 325 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:18464081..18465914 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 21600.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.61 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 191 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGEKPWQPLL QSFEKLSNCV QTHLSNFIGI KNTPPSSQST IQNPIISLDS SPPIATNSSS LQKLPLKDKS TGPVTKEDLG RATWTFLHTL AAQYPEKPTR 101: QQKKDVKELM TILSRMYPCR ECADHFKEIL RSNPAQAGSQ EEFSQWLCHV HNTVNRSLGK LVFPCERVDA RWGKLECEQK SCDLHGTSMD F |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)