AT2G42670.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.999 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Protein of unknown function (DUF1637) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Protein of unknown function (DUF1637); FUNCTIONS IN: cysteamine dioxygenase activity; INVOLVED IN: oxidation reduction; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF1637 (InterPro:IPR012864); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Protein of unknown function (DUF1637) (TAIR:AT3G58670.3); Has 364 Blast hits to 364 proteins in 96 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 106; Fungi - 0; Plants - 223; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 35 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:17772004..17773700 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 27184.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.50 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 241 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MPYFAQRLYN TCKASFSSDG PITEDALEKV RNVLEKIKPS DVGIEQDAQL ARSRSGPLNE RNGSNQSPPA IKYLHLHECD SFSIGIFCMP PSSMIPLHNH 101: PGMTVLSKLV YGSMHVKSYD WLEPQLTEPE DPSQARPAKL VKDTEMTAQS PVTTLYPKSG GNIHCFKAIT HCAILDILAP PYSSEHDRHC TYFRKSRRED 201: LPGELEVDGE VVTDVTWLEE FQPPDDFVIR RIPYRGPVIR T |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)