AT2G46110.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ketopantoate hydroxymethyltransferase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a ketopentoate hydroxymethyltransferase that appears to localize to the mitochondria. This protein is expected to play a role in pantothenate (vitamin B5) biosynthesis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ketopantoate hydroxymethyltransferase 1 (KPHMT1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pyruvate/Phosphoenolpyruvate kinase, catalytic core (InterPro:IPR015813), Ketopantoate hydroxymethyltransferase (InterPro:IPR003700); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Phosphoenolpyruvate carboxylase family protein (TAIR:AT3G61530.2); Has 7565 Blast hits to 7565 proteins in 2036 species: Archae - 128; Bacteria - 4147; Metazoa - 4; Fungi - 140; Plants - 59; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 3087 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:18954807..18956411 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 36695.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.48 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 347 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASSLTRNCS RFSKAISVRF MSNLPENTVY GGPKPQNPNQ RVTLTHLRQK HRRGEPITVV TAYDYPSAVH LDTAGIDVCL VGDSASMVVH GHDTTLPISL 101: DEMLVHCRAV ARGAKRPLLV GDLPFGTYES SSSQAVDTAV RVLKEGGMDA IKLEGGSASR ITAAKAIVEA GIAVIGHVGL TPQAISVLGG FRPQGRNIAS 201: AVKVVETAMA LQEAGCFSVV LECVPPPVAA AATSALKIPT IGIGAGPFCS GQVLVYHDLL GMMQHPHHAK VTPKFCKQYA NVGEVINKAL MEYKEEVSKK 301: VFPGPSHSPY KITASELDGF LTELQKLGFD KAASAAALAA ENMEPSK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)