AT2G20270.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Thioredoxin superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Thioredoxin superfamily protein; FUNCTIONS IN: electron carrier activity, arsenate reductase (glutaredoxin) activity, protein disulfide oxidoreductase activity; INVOLVED IN: cell redox homeostasis; LOCATED IN: chloroplast, chloroplast stroma; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glutaredoxin (InterPro:IPR002109), Glutaredoxin subgroup (InterPro:IPR014025), Glutaredoxin, eukaryotic/virial (InterPro:IPR011899), Thioredoxin-like fold (InterPro:IPR012336); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Glutaredoxin family protein (TAIR:AT4G28730.1); Has 5647 Blast hits to 5632 proteins in 1225 species: Archae - 8; Bacteria - 2859; Metazoa - 470; Fungi - 354; Plants - 907; Viruses - 110; Other Eukaryotes - 939 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:8738001..8739617 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 19126.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 179 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVAATVNLAN MTWTSLNSNP AISFSMLSGI RNLGMLPFRR CLKPTVIGIA SWPPLRCSSV KAMSSSSSSS GSTLEETVKT TVAENPVVVY SKTWCSYSSQ 101: VKSLFKSLQV EPLVVELDQL GSEGSQLQNV LEKITGQYTV PNVFIGGKHI GGCSDTLQLH NKGELEAILA EANGKNGQT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)