AT2G44750.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.553 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : thiamin pyrophosphokinase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a thiamine pyrophosphokinase capable of producing thiamine pyrophosphate from free thiamine. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
thiamin pyrophosphokinase 2 (TPK2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Thiamin pyrophosphokinase, vitamin B1-binding domain (InterPro:IPR007373), Thiamin pyrophosphokinase, eukaryotic (InterPro:IPR016966), Thiamin pyrophosphokinase (InterPro:IPR006282), Thiamin pyrophosphokinase, catalytic domain (InterPro:IPR007371); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: thiamin pyrophosphokinase1 (TAIR:AT1G02880.3); Has 1413 Blast hits to 1411 proteins in 581 species: Archae - 0; Bacteria - 767; Metazoa - 135; Fungi - 134; Plants - 93; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 284 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:18451510..18452754 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 29974.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 265 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLSAMDVMIH SSSFLLPCDE TCGTRYALVV LNQNLPRFTP LLWEHAKLRL CADGGANRIY DELPLFFPHE DPFVIRNRYK PDVIKGDMDS IRRDVLDFYV 101: YWGTKVIDES HDQDTTDLDK CISYIRHSTL NQESSRILAT GALGGRFDHE AGNLNVLYRY PDTRIVLLSD DCLIQLLPKT HRHEIHIHSS LQGPHCGLIP 201: IGTPSANTTT SGLKWDLSNT EMRFGGLIST SNLVKEEIIT VESDSDLLWT ISIKKTGLPV QDHKP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)