AT2G44140.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 0.991 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Peptidase family C54 protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Peptidase family C54 protein; FUNCTIONS IN: peptidase activity; INVOLVED IN: autophagy; LOCATED IN: chloroplast; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidase C54 (InterPro:IPR005078); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Peptidase family C54 protein (TAIR:AT3G59950.1); Has 835 Blast hits to 797 proteins in 214 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 427; Fungi - 180; Plants - 81; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 147 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:18255106..18257165 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 51531.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.92 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 467 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKALCDRFVP QQCSSSSKSD THDKSPLVSD SGPSDNKSKF TLWSNVFTSS SSVSQPYRES STSGHKQVCT TRNGWTAFVK RVSMASGAIR RFQERVLGPN 101: RTGLPSTTSD VWLLGVCYKI SADENSGETD TGTVLAALQL DFSSKILMTY RKGFEPFRDT TYTSDVNWGC MIRSSQMLFA QALLFHRLGR AWTKKSELPE 201: QEYLETLEPF GDSEPSAFSI HNLIIAGASY GLAAGSWVGP YAICRAWESL ACKKRKQTDS KNQTLPMAVH IVSGSEDGER GGAPILCIED ATKSCLEFSK 301: GQSEWTPIIL LVPLVLGLDS VNPRYIPSLV ATFTFPQSVG ILGGKPGAST YIVGVQEDKG FYLDPHEVQQ VVTVNKETPD VDTSSYHCNV LRYVPLESLD 401: PSLALGFYCR DKDDFDDFCL RALKLAEESN GAPLFTVTQT HTAINQSNYG FADDDSEDER EDDWQML |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)