AT2G35120.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Single hybrid motif superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Single hybrid motif superfamily protein; FUNCTIONS IN: glycine dehydrogenase (decarboxylating) activity, ATP binding; INVOLVED IN: glycine catabolic process, glycine decarboxylation via glycine cleavage system; LOCATED IN: mitochondrion, glycine cleavage complex; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: 2-oxo acid dehydrogenase, lipoyl-binding site (InterPro:IPR003016), Single hybrid motif (InterPro:IPR011053), Glycine cleavage H-protein (InterPro:IPR002930), Glycine cleavage H-protein, subgroup (InterPro:IPR017453); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Single hybrid motif superfamily protein (TAIR:AT1G32470.1); Has 7147 Blast hits to 7147 proteins in 2201 species: Archae - 168; Bacteria - 4552; Metazoa - 187; Fungi - 130; Plants - 205; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1905 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:14805913..14807274 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 17100.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.75 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 156 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MACRLFWASR VASHLRISVA QRGFSSVVLK DLKYADSHEW VKIDGNKATF GITDHAQDHL GDVVYVELPD VGHSVSQGKS FGAVESVKAT SDINSPVSGK 101: VVEVNEELTE SPGLVNSSPY EQGWIIKVEL SDAGEAEKLM DSDKYSKFCE EEDAKH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)