AT2G30105.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.755 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Leucine-rich repeat, typical subtype (InterPro:IPR003591), Leucine-rich repeat (InterPro:IPR001611), Ubiquitin (InterPro:IPR000626), Ubiquitin supergroup (InterPro:IPR019955); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Leucine-rich repeat (LRR) family protein (TAIR:AT5G07910.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:12849855..12851908 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 40524.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.92 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 367 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MADSTIKLTV KFGGKSIPLS VSPDCTVKDL KSQLQPITNV LPRGQKLIFK GKVLVETSTL KQSDVGSGAK LMLMASQGLH QGEGPILKEA SIRPISRTVV 101: SDKVDQRKPS VLVDKNRTDR WKATGVIALA QANLKEIPEE VWDCGSGVRV LDISENFIKE VPAKISSFGS MQKLFLQGNG LSDESIQWEG IASLKRLMLL 201: SISHNNLTVL PSAMGSLTSL RQLDVTNNKL TSLPNELGLL TQLEILKANN NRITSLPESI GNCSFLMEVD LSANIISELP ETFTKLRNLK TLELNNTGLK 301: TLPSALFKMC LQLSTLGLHN TEITVEFLRQ FEGYDDFDER RRTKHQKQLD FRVVGSGQFD EGADKSW |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)