AT2G26975.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Ctr copper transporter family | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Ctr copper transporter family; FUNCTIONS IN: copper ion transmembrane transporter activity; INVOLVED IN: copper ion transport; LOCATED IN: vacuole; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ctr copper transporter (InterPro:IPR007274); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: copper transporter 2 (TAIR:AT3G46900.1); Has 384 Blast hits to 384 proteins in 117 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 136; Fungi - 49; Plants - 163; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 36 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:11512992..11513429 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 15806.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.50 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.51 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 145 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDHGNMPPSS PSSMVNHTNS NMIMMHMTFF WGKNTEILFS GWPGTSLGMY VLCLIVVFLL AVIVEWLAHS SILRGRGSTS RAKGLVQTAV YTLKTGLAYL 101: VMLAVMSFNG GVFIVAIAGF AVGFMLFGST AFKNPSDDEK PFEQL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)