AT2G24090.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Ribosomal protein L35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Ribosomal protein L35; FUNCTIONS IN: structural constituent of ribosome; INVOLVED IN: translation; LOCATED IN: ribosome, chloroplast; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein L35, conserved site (InterPro:IPR018265), Ribosomal protein L35, non-mitochondrial (InterPro:IPR001706), Ribosomal protein L35 (InterPro:IPR021137); Has 5391 Blast hits to 5391 proteins in 1946 species: Archae - 0; Bacteria - 4062; Metazoa - 6; Fungi - 2; Plants - 66; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1255 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:10242038..10243416 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 16089.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 12.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.43 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 145 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASLSMASVN VSFCHPLRSS SPKVSLRSSV HFATSLSSSH SISGLRAVLP LKISTVASPN SQKLHSFTVF AHKGYKMKTH KASAKRFRVT GRGKIVRRRS 101: GKQHLLAKKN NKRKLRLSKM TEVNRSDYDN VIGALPYLKV NRKAT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)