AT2G23550.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.675 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : methyl esterase 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein predicted to act as a carboxylesterase. It has similarity to the SABP2 methyl salicylate esterase from tobacco but no enzymatic activity has been identified for this protein. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
methyl esterase 6 (MES6); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Alpha/beta hydrolase fold-1 (InterPro:IPR000073); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: methyl esterase 4 (TAIR:AT2G23580.1); Has 1505 Blast hits to 1503 proteins in 340 species: Archae - 0; Bacteria - 765; Metazoa - 4; Fungi - 18; Plants - 606; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 112 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:10027813..10028767 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 29745.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.06 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 265 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MENKNQKRFV LIHGVCHGAW TWDKVKTQLE VAGHCVTAVD LAASGINMTK VEEIQTLNDY CKPLLEFLSS LGSDDGKVIV VAHSMGGISA ALAADSFACK 101: IAAIVFLTAF MPDTINPPAY VYEKLLRSIP QEEWLDTTCV NYGKPDFPLQ YTLLGPKFMA KKMYQNSPVQ DLEVVKTLVR ENPLVTNNLA GTRSFSEEGY 201: GSVTRIYIVC REDLVEVEDY QRWMISNFPP KEVMEIKCAD HMPMFSKPQE VCALLLEIAN KYCKN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)