AT2G23580.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.847 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : methyl esterase 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein shown to have carboxylesterase activity and methyl salicylate esterase activity in vitro. This protein does not act on methyl IAA, methyl JA, MeGA4, or MEGA9 in vitro. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
methyl esterase 4 (MES4); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Alpha/beta hydrolase fold-1 (InterPro:IPR000073); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: methyl esterase 6 (TAIR:AT2G23550.1); Has 1450 Blast hits to 1448 proteins in 324 species: Archae - 0; Bacteria - 694; Metazoa - 0; Fungi - 30; Plants - 611; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 115 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:10033360..10034310 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 29583.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 263 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEKNNKKRFV LVHGLCHGAW CWYKVKTHLE AVGHCVTAVD LAASGINMTR LEEIQTLKDY CKPLLELLNS LGSDDDKVIL VAHSMGGIPA ALASDIFPSK 101: IATIVFLTAF MPDTRNLPAY VYQKLIRSVP QEGWLDTVFG TYGKHECPLE FALFGPKFMA KNLYQLSPVQ DLELAKMLVR VNPIITNNLA GTRSFSEEGY 201: GTVTRIYIVC GEDMAVPEDY QWWMIKNFPP KEVMEIKCAD HMAMFSKPHK LCALLVEIAC KYA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)