AT2G22360.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : DNAJ heat shock family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
DNAJ heat shock family protein; FUNCTIONS IN: unfolded protein binding, heat shock protein binding, ATP binding; INVOLVED IN: protein folding, response to heat; LOCATED IN: chloroplast thylakoid membrane, chloroplast; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Molecular chaperone, heat shock protein, Hsp40, DnaJ (InterPro:IPR015609), HSP40/DnaJ peptide-binding (InterPro:IPR008971), Chaperone DnaJ, C-terminal (InterPro:IPR002939), Heat shock protein DnaJ, N-terminal (InterPro:IPR001623), Heat shock protein DnaJ, conserved site (InterPro:IPR018253), Heat shock protein DnaJ, cysteine-rich domain (InterPro:IPR001305), Chaperone DnaJ (InterPro:IPR012724), Heat shock protein DnaJ (InterPro:IPR003095); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Molecular chaperone Hsp40/DnaJ family protein (TAIR:AT4G39960.1); Has 29493 Blast hits to 29023 proteins in 3518 species: Archae - 206; Bacteria - 11054; Metazoa - 4574; Fungi - 2545; Plants - 2863; Viruses - 57; Other Eukaryotes - 8194 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:9498162..9500459 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 47763.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.49 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.44 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 442 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAIIQLGSTC VAQWSIRPQF AVRAYYPSRI ESTRHQNSSS QVNCLGASKS SMFSHGSLPF LSMTGMSRNM HPPRRGSRFT VRADADYYSV LGVSKNATKA 101: EIKSAYRKLA RNYHPDVNKD PGAEEKFKEI SNAYEVLSDD EKKSLYDRYG EAGLKGAAGF GNGDFSNPFD LFDSLFEGFG GGMGRGSRSR AVDGQDEYYT 201: LILNFKEAVF GMEKEIEISR LESCGTCEGS GAKPGTKPTK CTTCGGQGQV VSAARTPLGV FQQVMTCSSC NGTGEISTPC GTCSGDGRVR KTKRISLKVP 301: AGVDSGSRLR VRGEGNAGKR GGSPGDLFVV IEVIPDPILK RDDTNILYTC KISYIDAILG TTLKVPTVDG TVDLKVPAGT QPSTTLVMAK KGVPVLNKSN 401: MRGDQLVRVQ VEIPKRLSKE EKKLIEELAD MSKNKTANST SR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)