AT2G19310.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : HSP20-like chaperones superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
HSP20-like chaperones superfamily protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: HSP20-like chaperone (InterPro:IPR008978); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: HSP20-like chaperones superfamily protein (TAIR:AT1G07400.1); Has 749 Blast hits to 749 proteins in 86 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 34; Plants - 701; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 14 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:8369892..8370380 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 18529.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 162 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSMIPISNRR RLSPGDRIWE PFELMNTFLD FPSPALFLSH HFPSLSREIF PQTSSSTVNT QLNWTETPTA HVFKAYLPGV DQDEVIAFVD EEGYLQICTG 101: DNKFMSRFKL PNNALTDQVT AWMEDEFLVV FVEKDASSSP PQLPEIEENR NVRVVEITGD DD |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)