AT2G17640.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : Trimeric LpxA-like enzymes superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a cytosolic serine O-acetyltransferase involved in sulfur assimilation and cysteine biosynthesis. Expressed in the vascular system. Expression is induced after long-term sulfur starvation. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ATSERAT3;1; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Hexapeptide transferase, conserved site (InterPro:IPR018357), Serine O-acetyltransferase (InterPro:IPR005881), Trimeric LpxA-like (InterPro:IPR011004), Serine acetyltransferase, N-terminal (InterPro:IPR010493); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: serine acetyltransferase 3;2 (TAIR:AT4G35640.1); Has 24316 Blast hits to 24306 proteins in 2619 species: Archae - 371; Bacteria - 18535; Metazoa - 5; Fungi - 223; Plants - 313; Viruses - 18; Other Eukaryotes - 4851 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:7668238..7670226 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 34536.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 323 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MNGDELPFES GFEVYAKGTH KSEFDSNLLD PRSDPIWDAI REEAKLEAEK EPILSSFLYA GILAHDCLEQ ALGFVLANRL QNPTLLATQL LDIFYGVMMH 101: DKGIQSSIRH DLQAFKDRDP ACLSYSSAIL HLKGYHALQA YRVAHKLWNE GRKLLALALQ SRISEVFGID IHPAARIGEG ILLDHGTGVV IGETAVIGNG 201: VSILHGVTLG GTGKETGDRH PKIGEGALLG ACVTILGNIS IGAGAMVAAG SLVLKDVPSH SVVAGNPAKL IRVMEEQDPS LAMKHDATKE FFRHVADGYK 301: GAQSNGPSLS AGDTEKGHTN STS |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)