AT1G79040.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : photosystem II subunit R | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes for the 10 kDa PsbR subunit of photosystem II (PSII). This subunit appears to be involved in the stable assembly of PSII, particularly that of the oxygen-evolving complex subunit PsbP. Mutants defective in this gene have reduced amounts of subunits PsbP and PsbQ in PSII. In turn, assembly of PsbR is dependent on the presence of PsbJ. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
photosystem II subunit R (PSBR); FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: photosystem II oxygen evolving complex assembly, photosynthesis, response to light intensity; LOCATED IN: thylakoid, chloroplast thylakoid membrane, chloroplast, photosystem II; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Photosystem II protein PsbR (InterPro:IPR006814); Has 134 Blast hits to 134 proteins in 52 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 2; Fungi - 0; Plants - 129; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 3 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:29736085..29736781 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 14586.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.00 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 140 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAASVMLSSV TLKPAGFTVE KTAARGLPSL TRARPSFKIV ASGVKKIKTD KPFGINGSMD LRDGVDASGR KGKGYGVYKY VDKYGANVDG YSPIYNENEW 101: SASGDVYKGG VTGLAIWAVT LAGILAGGAL LVYNTSALAQ |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)