AT1G76100.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : plastocyanin 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
One of two Arabidopsis plastocyanin genes. Expressed at 1/10th level of PETE2. Does not respond to increased copper levels and is thought to be the isoform that participates in electron transport under copper-limiting conditions. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
plastocyanin 1 (PETE1); FUNCTIONS IN: electron carrier activity, copper ion binding; LOCATED IN: thylakoid, thylakoid lumen, chloroplast thylakoid lumen, chloroplast; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Blue (type 1) copper protein (InterPro:IPR001235), Cupredoxin (InterPro:IPR008972), Plastocyanin (InterPro:IPR002387), Blue (type 1) copper domain (InterPro:IPR000923); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Cupredoxin superfamily protein (TAIR:AT1G20340.1); Has 1305 Blast hits to 1299 proteins in 244 species: Archae - 140; Bacteria - 448; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 204; Viruses - 5; Other Eukaryotes - 508 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:28554217..28554732 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 17590.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.75 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 171 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAAITSATVT IPSFTGLKLA VSSKPKTLST ISRSTSATRA PPKLALKSSL KDFGVIAVAT AASIVLAGNA MAMEVLLGSD DGSLAFVPSE FTVAKGEKIV 101: FKNNAGFPHN VVFDEDEIPS GVDASKISMD ETALLNGAGE TYEVTLTEPG SYGFYCAPHQ GAGMVGKLTV K |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)