AT1G74250.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : DNAJ heat shock N-terminal domain-containing protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
DNAJ heat shock N-terminal domain-containing protein; FUNCTIONS IN: heat shock protein binding, zinc ion binding, nucleic acid binding; INVOLVED IN: protein folding; LOCATED IN: intracellular; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Zinc finger, C2H2-like (InterPro:IPR015880), Molecular chaperone, heat shock protein, Hsp40, DnaJ (InterPro:IPR015609), Zinc finger, U1-type (InterPro:IPR003604), Heat shock protein DnaJ, N-terminal (InterPro:IPR001623), Zinc finger, C2H2-type (InterPro:IPR007087), Zinc finger, double-stranded RNA binding (InterPro:IPR022755), Heat shock protein DnaJ, conserved site (InterPro:IPR018253); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: DnaJ domain ;Myb-like DNA-binding domain (TAIR:AT3G11450.1); Has 93426 Blast hits to 65819 proteins in 3757 species: Archae - 599; Bacteria - 15939; Metazoa - 31666; Fungi - 9634; Plants - 4994; Viruses - 419; Other Eukaryotes - 30175 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:27920328..27922414 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 72479.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.82 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -1.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 630 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASSSRSEKR CHYEVLGISK ESSPDEIRSS YRRLALQRHP DKLMKAAGLS EAEATAQFQE LVHAYEVLSD PKERAWYDSH RSQILFADHS SAGGSKSGGS 101: VPDLFAFFSP TVYSGYSDTG KGFYKVYYDV FNSVYLNEIK FARTLGLRMD SVREAPIMGN LESPYAQVTA FYNYWLGFCT VMDFCWVDEY DVMGGPNRKS 201: RRMMEEENKK SRKKAKREYN DTVRGLAEFV KKRDKRVIDM LVKKNAEMEK KKEEERERKK KMEKERLERA MNYEEPEWAK AHEGEDEGAG LSELEEEDDD 301: AKRKNEQLYC IVCSKKFKSE KQWKNHEQSK KHKEKVAELR ESFTDYEEEN EEEEIDGPLD SPESVEELHE KLQEELNIDN EERDVKKEVV GEADETDDEY 401: FVAEEDMQGS SESEDEDDEM TLLKKMVSGQ KNKQKNVVSK EEDEDETEVE IEGDTAEFSE FDNQKSTGRN KEAKEERNKQ NAGNDMADDT SKVQIPGEGG 501: NPDENMNATE SASGALADSQ KDEANSMEYD NRKSTGRRRR SKKGKDKNNQ GELNEKSSEA DDTQYVNRDM ESQDYKKAPR SKKSTRGMKT KGTTKKNSSN 601: ECDRCGEEFE SRTKLHKHLA DSGHATVKSR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)