AT1G69800.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 0.553 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Cystathionine beta-synthase (CBS) protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Cystathionine beta-synthase (CBS) protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cystathionine beta-synthase, core (InterPro:IPR000644); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: SNF1-related protein kinase regulatory subunit gamma 1 (TAIR:AT3G48530.1); Has 879 Blast hits to 799 proteins in 237 species: Archae - 117; Bacteria - 170; Metazoa - 187; Fungi - 63; Plants - 180; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 162 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:26274416..26276105 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 47820.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.00 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 447 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAGSEAVEDK EIKSAVSSCE AYFEKVQSRK NLPKSLQETL NSAFAGIPVS SFPQVPGGRV IEIQAETPVS EAVKILSDSK ILSAPVINTD HESSLDWRER 101: YLGIIDYSSI ILWVLESAEL AAIALSATSA TAAGVGAGAV GALGVAALGM TGPVAAAGLA AAAVGAAVAG GVAAERGIGK DAPTAADKLG KDFYEVILQE 201: EPFKSTTVRT ILKSFRWAPF LPVSTESSML SVMLLLSKYR LRNVPVIKTG EPDIKNYVTQ SAVVHGLEGC KGRDWFDHIS ALPISDLGLP FMSPNEVISI 301: ESEELILEAF KRMRDNNIGG LPVVEGLNKK IVGNISMRDI RYLLLQPEVF SNFRQLTVKS FATKIATAGE EYGLAIPAIT CRPDSTLGSV INSLASRSVH 401: RVYVAAGDEN ELYGVITLRD VISCFVSEPP NYFENCLGFS VKEMLNR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)