AT1G63660.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.724 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : GMP synthase (glutamine-hydrolyzing), putative / glutamine amidotransferase, putative | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
GMP synthase (glutamine-hydrolyzing), putative / glutamine amidotransferase, putative; FUNCTIONS IN: asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing) activity, catalytic activity, GMP synthase (glutamine-hydrolyzing) activity, ATP binding; INVOLVED IN: in 7 processes; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glutamine amidotransferase class-I, C-terminal (InterPro:IPR000991), Glutamine amidotransferase superfamily (InterPro:IPR011702), GMP synthase, N-terminal (InterPro:IPR004739), GMP synthase, C-terminal (InterPro:IPR001674), Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold (InterPro:IPR014729), Glutamine amidotransferase type 1 (InterPro:IPR017926), Asparagine synthase (InterPro:IPR001962), Anthranilate synthase component II/delta crystallin (InterPro:IPR006220); Has 20887 Blast hits to 20751 proteins in 2946 species: Archae - 738; Bacteria - 12164; Metazoa - 273; Fungi - 298; Plants - 185; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 7229 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:23604127..23607080 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 59318.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.51 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 534 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: METPTMKPDT VLILDYGSQY THLITRRIRS LNVFSLVISG TSSLKSITSY NPRVVILSGG PHSVHALDAP SFPEGFIEWA ESNGVSVLGI CYGLQLIVQK 101: LGGVVVEGES KEYGKMEIEV KGKSEIFGSE SGGEKQMVWM SHGDEAVKLP EGFEVVAQSA QGAVAALESR KKKIYGLQYH PEVTHSPKGM ETLRHFLFDV 201: CGVSADWKME DLMEEEIKVI NKTVASDEHV ICALSGGVDS TVAATLVHKA IGDRLHCIFV DNGLLRYKEQ ERVMDTFERD LHLPVTCVDA SERFLSELKG 301: VVDPETKRKI IGREFINIFD QFAQELEKKH GKKPAFLVQG TLYPDVIESC PPPGTDRTHS HTIKSHHNVG GLPKDMKLKL IEPLKLLFKD EVRELGRILN 401: VPVGFLKRHP FPGPGLAVRV LGDVTQGNAL EVLRQVDEIF IQSIRDAGLY DSIWQAFAVF LPVRSVGVQG DKRTHSHVVA LRAVTSQDGM TADWFNFEHK 501: FLDDVSRKIC NSVQGVNRVV LDITSKPPST IEWE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)