AT5G14520.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : pescadillo-related | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
pescadillo-related; FUNCTIONS IN: transcription coactivator activity; INVOLVED IN: cell proliferation; LOCATED IN: nucleolus, intracellular; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pescadillo, N-terminal (InterPro:IPR010613), BRCT (InterPro:IPR001357); Has 503 Blast hits to 494 proteins in 230 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 173; Fungi - 168; Plants - 48; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 114 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:4680789..4684330 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 67947.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.99 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.54 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 590 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MPKHYRPTGK KKEGNAARYM TRSQALKHLQ VNLNLFRRLC IVKGIFPREP KKKIKGNHHT YYHVKDIAFL MHEPLLEKFR EIKTYQKKVK KAKAKKNEEL 101: ARLLLTRQPT YKLDRLIRER YPTFIDALRD LDDCLTMVHL FAVLPASDRE NLEVKRVHNC RRLTHEWQAY ISRSHALRKV FVSVKGIYYQ AEIEGQKITW 201: LTPHAIQQVF TNDVDFGVLL TFLEFYETLL AFINFKLYHS LNVKYPPILD SRLEALAADL YALSRYIDAS SRGMAVEPKV DASFSSQSND REESELRLAQ 301: LQHQLPSSEP GALMHLVADN NKEVEEDEET RVCKSLFKDL KFFLSREVPR ESLQLVITAF GGMVSWEGEG APFKEDDESI THHIIDKPSA GHLYLSRVYV 401: QPQWIYDCVN ARIILPTEKY LVGRIPPPHL SPFVDNEAEG YVPDYAETIK RLQAAARNEV LPLPGVGKED LEDPQNLLYA GVMSRAEEAE AAKNKKKMAA 501: QEKQYHEELK MEINGSKDVV APVLAEGEGE ESVPDAMQIA QEDADMPKVL MSRKKRKLYD AMKISQSRKR SGVEIIEQRK KRLNDTQPSS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)