AT1G58280.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Phosphoglycerate mutase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Phosphoglycerate mutase family protein; LOCATED IN: chloroplast; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Histidine phosphatase superfamily, clade-1 (InterPro:IPR013078); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Phosphoglycerate mutase family protein (TAIR:AT5G64460.8); Has 589 Blast hits to 589 proteins in 110 species: Archae - 0; Bacteria - 12; Metazoa - 0; Fungi - 285; Plants - 167; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 125 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:21620497..21622468 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 35479.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.87 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.37 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 318 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MIHQSMTSNL SFYISSVSHL SSPLPSLSRL SLRCCSSLPA HDMETKPSQG LYPLHRCKTI HLVRHAQGIH NVEGEKNHKA YLSEDLFDAH LTPLGWQQVD 101: NLHKHVNASG ISNRIELVVV SPLLRTLQTA VGTFGGEGYK DGVNTPLLMT AGAGNSDRPA ISRLNRPPFI AVESCREHLG VHPCDRRSNI TKYRELFPAI 201: DFSLIETDED VLWKPDIREE DKDIATRGVK FFNWLSTRKE KEIAVVTHSG FLYQTLNSFG NDCDPSVKNE ISKKFVNCEL RSFVLVDKCM SSSDPPMTNY 301: PGTILTGEDA SSDIADQK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)