AT1G55090.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:peroxisome 0.746 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : carbon-nitrogen hydrolase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
carbon-nitrogen hydrolase family protein; FUNCTIONS IN: hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds, NAD+ synthase (glutamine-hydrolyzing) activity, ATP binding; INVOLVED IN: nitrogen compound metabolic process, NAD biosynthetic process; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold (InterPro:IPR014729), Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase (InterPro:IPR003010), NAD synthase (InterPro:IPR003694), Glutamine-dependent NAD(+) synthetase, GAT domain-containing (InterPro:IPR014445), NAD/GMP synthase (InterPro:IPR022310); Has 5923 Blast hits to 5903 proteins in 2409 species: Archae - 233; Bacteria - 4478; Metazoa - 145; Fungi - 142; Plants - 70; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 855 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:20554857..20558188 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 80904.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 725 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRLLKVATCN LNQWAMDFES NMKNIKASIA EAKAAGAVIR LGPELEVTGY GCEDHFLELD TVTHAWECLK ELLLGDWTDD ILCSIGMPVI KGAERYNCQV 101: LCMNRRIIMI RPKMWLANDG NYRELRWFTA WKQREELEEF QLPIEISEAL EQKSVPFGYG YIQFIDTAVA AEVCEELFSP LPPHAELALN GVEVFMNASG 201: SHHQLRKLDI RLNAFMGATH ARGGVYMYSN QQGCDGSRLY YDGCACIVVN GNVVAQGSQF SLRDVEVIIS QVDLDAVASL RGSISSFQEQ ASCKVKVSSV 301: AVPCRLTQSF NLKMTLSSPK KIIYHSPQEE IAFGPACWMW DYLRRSGASG FLLPLSGGAD SSSVAAIVGC MCQLVVKEIA KGDEQVKADA NRIGNYANGQ 401: FPTDSKEFAK RIFYTVFMGS ENSSEETKRR SKQLADEIGA WHLDVCIDGV VSAVLSLFQT VTGKRPRYKV DGGSNAENLG LQNIQARMRM VLAFMLASLL 501: PWVHSKPGFY LVLGSSNVDE GLRGYLTKYD CSSADINPIG SISKMDLRLF LKWAATNLGY PSLAEIEAAP PTAELEPIRS DYSQLDEVDM GMTYEELSVY 601: GRMRKIFRCG PVSMFKNLCY KWGTKLSPAE VAEKVKYFFK YYSINRHKMT VLTPSYHAES YSPEDNRFDL RQFLYNSKWP YQFKKIDEIV DSLNGDSVAF 701: PEEEANSNKE IGVVAANSGD PSAGL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)