AT1G79230.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 0.500 plastid 0.500 ASURE: mitochondrion,plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : mercaptopyruvate sulfurtransferase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a sulfurtransferase/rhodaneses, which belongs to a group of enzymes widely distributed in all three phyla that catalyze the transfer of sulfur from a donor to a thiophilic acceptor substrate. The protein and transcript levels are NOT affected by senescence or exogenous cyanide, suggesting that sulfurtransferases are involved in cyanide detoxification. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
mercaptopyruvate sulfurtransferase 1 (MST1); FUNCTIONS IN: 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase activity, sulfurtransferase activity, thiosulfate sulfurtransferase activity; INVOLVED IN: sulfate transport, aging; LOCATED IN: mitochondrion, chloroplast; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Rhodanese-like (InterPro:IPR001763), Thiosulphate sulfurtransferase, conserved site (InterPro:IPR001307); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: rhodanese homologue 2 (TAIR:AT1G16460.2); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:29800824..29803679 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 41895.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 379 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASTLFSRTF LAASHRLITP SLPQKIFNPA TFLSRSLHSQ LGSASTAYKS TTWARRAMAS TGVETKAGYS TSSVSTSEPV VSVDWLHANL REPDLKILDA 101: SWYMPDEQRN PIQEYQVAHI PRALFFDLDG ISDRKTSLPH MLPTEEAFAA GCSALGIDNK DEVVVYDGKG IFSAARVWWM FRVFGHEKVW VLDGGLPRWR 201: ASGYDVESSA SGDAILKASA ASEAIEKIYQ GQTVSPITFQ TKFQPHLVWT LDQVKNNMED PTYQHIDARS KARFDGTAPE PRKGIRSGHI PGSKCIPFPQ 301: MFDSCNTLLP AEELKKRFDQ EDISLDKPIM ASCGTGVTAC ILAMGLHRLG KTDVPIYDGS WTEWATQPDL PIESVESSS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)