AT1G31850.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:golgi 1.000 What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
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Computational Description (TAIR10) |
S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF248, methyltransferase putative (InterPro:IPR004159); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein (TAIR:AT4G19120.2); Has 1070 Blast hits to 1059 proteins in 86 species: Archae - 5; Bacteria - 108; Metazoa - 0; Fungi - 3; Plants - 946; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 8 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr1:+:11431165..11433443 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 68800.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 8.93 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.44 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 603 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKSGKQSSQP EKGTSRILSL TVLFIAFCGF SFYLGGIFCS ERDKIVAKDV TRTTTKAVAS PKEPTATPIQ IKSVSFPECG SEFQDYTPCT DPKRWKKYGV 101: HRLSFLERHC PPVYEKNECL IPPPDGYKPP IRWPKSREQC WYRNVPYDWI NKQKSNQHWL KKEGDKFHFP GGGTMFPRGV SHYVDLMQDL IPEMKDGTVR 201: TAIDTGCGVA SWGGDLLDRG ILSLSLAPRD NHEAQVQFAL ERGIPAILGI ISTQRLPFPS NAFDMAHCSR CLIPWTEFGG IYLLEIHRIV RPGGFWVLSG 301: PPVNYNRRWR GWNTTMEDQK SDYNKLQSLL TSMCFKKYAQ KDDIAVWQKL SDKSCYDKIA KNMEAYPPKC DDSIEPDSAW YTPLRPCVVA PTPKVKKSGL 401: GSIPKWPERL HVAPERIGDV HGGSANSLKH DDGKWKNRVK HYKKVLPALG TDKIRNVMDM NTVYGGFSAA LIEDPIWVMN VVSSYSANSL PVVFDRGLIG 501: TYHDWCEAFS TYPRTYDLLH LDSLFTLESH RCEMKYILLE MDRILRPSGY VIIRESSYFM DAITTLAKGI RWSCRREETE YAVKSEKILV CQKKLWFSSN 601: QTS |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)