AT1G19670.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 0.526 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : chlorophyllase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Chlorophyllase is the first enzyme involved in chlorophyll degradation. It catalyzes the hydrolysis of the ester bond to yield chlorophyllide and phytol. AtCLH1 lacks a typical signal sequence for the chloroplast. Its expression is induced rapidly by methyljasmonate, a known promoter of senescence and chlorophyll degradation. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
chlorophyllase 1 (CLH1); FUNCTIONS IN: chlorophyllase activity; INVOLVED IN: response to jasmonic acid stimulus, chlorophyll catabolic process, jasmonic acid mediated signaling pathway, response to stress; LOCATED IN: vacuole; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Chlorophyllase-like (InterPro:IPR010821), Chlorophyllase, chloroplast (InterPro:IPR017395); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: chlorophyllase 2 (TAIR:AT5G43860.1); Has 196 Blast hits to 192 proteins in 66 species: Archae - 2; Bacteria - 62; Metazoa - 6; Fungi - 0; Plants - 116; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 10 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:6803796..6804923 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 34856.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.54 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 324 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAAIEDSPTF SSVVTPAAFE IGSLPTTEIP VDPVENDSTA PPKPVRITCP TVAGTYPVVL FFHGFYLRNY FYSDVLNHIA SHGYILVAPQ LCKLLPPGGQ 101: VEVDDAGSVI NWASENLKAH LPTSVNANGK YTSLVGHSRG GKTAFAVALG HAATLDPSIT FSALIGIDPV AGTNKYIRTD PHILTYKPES FELDIPVAVV 201: GTGLGPKWNN VMPPCAPTDL NHEEFYKECK ATKAHFVAAD YGHMDMLDDD LPGFVGFMAG CMCKNGQRKK SEMRSFVGGI VVAFLKYSLW GEKAEIRLIV 301: KDPSVSPAKL DPSPELEEAS GIFV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)