AT1G15530.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: carbohydrate binding, kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: plasma membrane, vacuole; EXPRESSED IN: synergid, cultured cell; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Legume lectin, beta chain (InterPro:IPR001220), Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup (InterPro:IPR013320), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Concanavalin A-like lectin/glucanase (InterPro:IPR008985), Legume lectin, beta chain, Mn/Ca-binding site (InterPro:IPR019825); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein (TAIR:AT4G29050.1); Has 122402 Blast hits to 120886 proteins in 4615 species: Archae - 112; Bacteria - 13960; Metazoa - 45016; Fungi - 10521; Plants - 34601; Viruses - 479; Other Eukaryotes - 17713 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:5339961..5341931 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 73149.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.85 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 656 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSWQWRRRQW PSPLLLILIV LHLVSSSSAI DFLYNSFSSV TNRTDVILIE DSRVESTVIS LINDSDPLSF GRVFYPQKLT IIPDPTRNPT RLSSFSTSFV 101: FSILPDISTS PGFGLCFVLS NSTSPPNAIS SQYFGLFTNA TVRFNAPLLA VEFDTGRNSE VNDIDDNHVG IDLNNIESTT SVTAGYYDSV NGSFVRFNMR 201: NGNNVRAWID FDGPNFQINV SVAPVGVLRP RRPTLTFRDP VIANYVSADM YAGFSASKTN WNEARRILAW SLSDTGALRE INTTNLPVFF LENSSSSLST 301: GAIAGIVIGC VVFVALIGFG GYLIWKKLMR EEEEEEIEEW ELEFWPHRFS YEELAAATEV FSNDRLLGSG GFGKVYRGIL SNNSEIAVKC VNHDSKQGLR 401: EFMAEISSMG RLQHKNLVQM RGWCRRKNEL MLVYDYMPNG SLNQWIFDNP KEPMPWRRRR QVINDVAEGL NYLHHGWDQV VIHRDIKSSN ILLDSEMRGR 501: LGDFGLAKLY EHGGAPNTTR VVGTLGYLAP ELASASAPTE ASDVYSFGVV VLEVVSGRRP IEYAEEEDMV LVDWVRDLYG GGRVVDAADE RVRSECETME 601: EVELLLKLGL ACCHPDPAKR PNMREIVSLL LGSPQEDLLT GLTPAAAAAD STAAHA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)