AT1G14870.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : PLANT CADMIUM RESISTANCE 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
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Computational Description (TAIR10) |
PLANT CADMIUM RESISTANCE 2 (PCR2); FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: response to oxidative stress; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: callus; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function Cys-rich (InterPro:IPR006461); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: PLAC8 family protein (TAIR:AT5G35525.1); Has 803 Blast hits to 802 proteins in 112 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 123; Fungi - 115; Plants - 527; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 38 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr1:-:5128591..5129458 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 16743.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 6.91 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 152 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEAQHLHAKP HAEGEWSTGF CDCFSDCKNC CITFWCPCIT FGQVAEIVDR GSTSCGTAGA LYALIAVVTG CACIYSCFYR GKMRAQYNIK GDDCTDCLKH 101: FCCELCSLTQ QYRELKHRGY DMSLGWAGNV ERQQNQGGVA MGAPVFQGGM TR |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)