AT1G14140.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Mitochondrial substrate carrier family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Mitochondrial substrate carrier family protein; FUNCTIONS IN: transporter activity, binding; INVOLVED IN: transport, mitochondrial transport, transmembrane transport; LOCATED IN: mitochondrial inner membrane, membrane; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mitochondrial substrate carrier (InterPro:IPR001993), Mitochondrial substrate/solute carrier (InterPro:IPR018108), Adenine nucleotide translocator 1 (InterPro:IPR002113); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: uncoupling protein 2 (TAIR:AT5G58970.1); Has 28913 Blast hits to 14062 proteins in 461 species: Archae - 0; Bacteria - 4; Metazoa - 12057; Fungi - 8822; Plants - 5230; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 2797 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:4838131..4839602 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 33442.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 305 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MERSRVTREA PTGTRILLAS LSAMVAESVT FPIDLTKTRM QLHGSGSASG AHRIGAFGVV SEIARKEGVI GLYKGLSPAI IRHLFYTPIR IIGYENLKGL 101: IVRSETNNSE SLPLATKALV GGFSGVIAQV VASPADLVKV RMQADGRLVS QGLKPRYSGP IEAFTKILQS EGVKGLWKGV LPNIQRAFLV NMGELACYDH 201: AKHFVIDKKI AEDNIFAHTL ASIMSGLAST SLSCPADVVK TRMMNQGENA VYRNSYDCLV KTVKFEGIRA LWKGFFPTWA RLGPWQFVFW VSYEKFRLLA 301: GISSF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)