AT1G13090.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.744 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cytochrome P450, family 71, subfamily B, polypeptide 28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
putative cytochrome P450 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cytochrome P450, family 71, subfamily B, polypeptide 28 (CYP71B28); FUNCTIONS IN: electron carrier activity, monooxygenase activity, iron ion binding, oxygen binding, heme binding; INVOLVED IN: oxidation reduction; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome P450 (InterPro:IPR001128), Cytochrome P450, E-class, group I (InterPro:IPR002401), Cytochrome P450, conserved site (InterPro:IPR017972); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Cytochrome P450 superfamily protein (TAIR:AT3G26830.1); Has 32313 Blast hits to 32069 proteins in 1664 species: Archae - 46; Bacteria - 2999; Metazoa - 11820; Fungi - 6857; Plants - 9495; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1096 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:4461846..4463400 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 56540.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 490 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSVFLCFLCL LPLILIFLKN LKPSKWKLPP GPKKLPIIGN LHQRRELHPR NSRNLSEKYG PIVFLRYGFV PVVVISSKEA AEEVLKTHDL ECCSRPETVG 101: TRAISYNFKD IGFAPYGEDW RTMRKLSVVE LFSSKKLQSF RYIREEENDL CVKKLSDLAS RRSLVNLEKT LFTLVGSIVC RIGFGINLRE CEFVDEDSID 201: DLVHKSEDVI RNSIFSDFFP GLMGRLIEWI FSERKRLNRL YSEVDTFFQN ILDDHLKPGR ESSDIIDVMI DMMKKQEKEG DSFKFTTDHL KGMISDIFLA 301: GVGTSSTTLI WAMTELIRNP RVMKKVQDEI RTTLGDKKER ITEEDLNQLH YFKLMVKEIF RLHPAAPLLL PRETLSHVKI QGYDIPAKTQ IMINAYAIAR 401: DPKLWTNPDE FNPDRFLDSS IDYRGLNFEL LPFGSGRRIC PGMTMGIAIV ELGLLNLLYF FDWGLPEKEE AKEIITGNEV ALDLVQVFLH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)