AT1G12050.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.999 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : fumarylacetoacetase, putative | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
fumarylacetoacetase, putative; FUNCTIONS IN: fumarylacetoacetase activity, catalytic activity; INVOLVED IN: aromatic amino acid family metabolic process, metabolic process; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Fumarylacetoacetase, C-terminal-like (InterPro:IPR002529), Fumarylacetoacetase, C-terminal-related (InterPro:IPR011234), Fumarylacetoacetase, N-terminal (InterPro:IPR015377), Fumarylacetoacetase (InterPro:IPR005959); Has 4441 Blast hits to 4434 proteins in 1063 species: Archae - 139; Bacteria - 2814; Metazoa - 297; Fungi - 179; Plants - 60; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 952 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:4072904..4075856 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 46098.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 421 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MALLKSFIDV GSDSHFPIQN LPYGVFKPES NSTPRPAVAI GDLVLDLSAI SEAGLFDGLI LKDADCFLQP NLNKFLAMGR PAWKEARSTL QRILSSNEPI 101: LRDNDVLRRK SFHQMSKVEM IVPMVIGDYT DFFASMHHAK NCGLMFRGPE NAINPNWFRL PIAYHGRASS IVISGTDIIR PRGQGHPQGN SEPYFGPSKK 201: LDFELEMAAV VGPGNELGKP IDVNNAADHI FGLLLMNDWS ARDIQAWEYV PLGPFLGKSF GTTISPWIVT LDALEPFGCQ APKQDPPPLP YLAEKESVNY 301: DISLEVQLKP SGRDDSCVIT KSNFQNLYWT ITQQLAHHTV NGCNLRPGDL LGTGTISGPE PDSYGCLLEL TWNGQKPLSL NGTTQTFLED GDQVTFSGVC 401: KGDGYNVGFG TCTGKIVPSP P |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)