AT1G08490.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : chloroplastic NIFS-like cysteine desulfurase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Chloroplastic NifS-like protein that can catalyze the conversion of cysteine into alanine and elemental sulfur (S(0)) and of selenocysteine into alanine and elemental Se (Se(0)). Overexpression enhances selenium tolerance and accumulation. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
chloroplastic NIFS-like cysteine desulfurase (CPNIFS); FUNCTIONS IN: transaminase activity, selenocysteine lyase activity, cysteine desulfurase activity; INVOLVED IN: iron incorporation into metallo-sulfur cluster, response to selenium ion, sulfur metabolic process, selenium metabolic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major domain (InterPro:IPR015424), Aminotransferase, class V/Cysteine desulfurase (InterPro:IPR000192), Cysteine desulfurase, SufS (InterPro:IPR010970), Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 1 (InterPro:IPR015421); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: nitrogen fixation S (NIFS)-like 1 (TAIR:AT5G65720.1); Has 22660 Blast hits to 22653 proteins in 2897 species: Archae - 350; Bacteria - 15408; Metazoa - 379; Fungi - 404; Plants - 268; Viruses - 1; Other Eukaryotes - 5850 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:2685980..2688547 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 50488.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.71 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 463 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEGVAMKLPS FPNAISIGHR SFSRVRCSSS LSVCSAAAAS SATISTDSES VSLGHRVRKD FRILHQEVNG SKLVYLDSAA TSQKPAAVLD ALQNYYEFYN 101: SNVHRGIHYL SAKATDEFEL ARKKVARFIN ASDSREIVFT RNATEAINLV AYSWGLSNLK PGDEVILTVA EHHSCIVPWQ IVSQKTGAVL KFVTLNEDEV 201: PDINKLRELI SPKTKLVAVH HVSNVLASSL PIEEIVVWAH DVGAKVLVDA CQSVPHMVVD VQKLNADFLV ASSHKMCGPT GIGFLYGKSD LLHSMPPFLG 301: GGEMISDVFL DHSTYAEPPS RFEAGTPAIG EAIALGAAVD YLSGIGMPKI HEYEVEIGKY LYEKLSSLPD VRIYGPRPSE SVHRGALCSF NVEGLHPTDL 401: ATFLDQQHGV AIRSGHHCAQ PLHRYLGVNA SARASLYFYN TKDDVDAFIV ALADTVSFFN SFK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)