AT1G07110.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : fructose-2,6-bisphosphatase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
Encodes the bifunctional enzyme fructose-6-phosphate 2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Computational Description (TAIR10) |
fructose-2,6-bisphosphatase (F2KP); FUNCTIONS IN: fructose-2,6-bisphosphate 2-phosphatase activity; INVOLVED IN: N-terminal protein myristoylation, fructose metabolic process; LOCATED IN: cytosol, plasma membrane; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Bifunctional 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2, 6-bisphosphate 2-phosphatase (InterPro:IPR016260), Phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase, active site (InterPro:IPR001345), Fructose-2,6-bisphosphatase (InterPro:IPR003094), Carbohydrate-binding-like fold (InterPro:IPR013784), Glycoside hydrolase, carbohydrate-binding (InterPro:IPR002044), Histidine phosphatase superfamily, clade-1 (InterPro:IPR013078), 6-phosphofructo-2-kinase (InterPro:IPR013079); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Plant transposase (Ptta/En/Spm family) (TAIR:AT3G30200.1); Has 5078 Blast hits to 4946 proteins in 1364 species: Archae - 8; Bacteria - 3312; Metazoa - 533; Fungi - 529; Plants - 140; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 556 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr1:-:2178363..2183980 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 82563.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 6.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 744 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGSGASKNTE EDDDGSNGGG GQLYVSLKME NSKVEGELTP HVYGSLPLIG SWDPSKALPM QRESALMSEL SFVVPPDHET LDFKFLLKPK NRNTPCIVEE 101: GENRLLTGGS LQGDARLALF RLEGDVIVEF RVFINADRVS PIDLATSWRA YRENLQPSTV RGIPDVSINP DPKSAECPLE SLELDLAHYE VPAPAPSANS 201: YLVYAADNAE NPRSLSASGS FRNDSTPKAA QRNSEDSGVT VDGSPSAKEM TIVVPDSSNI YSAFGEAESK SVETLSPFQQ KDGQKGLFVD RGVGSPRLVK 301: SLSASSFLID TKQIKNSMPA AAGAVAAAAV ADQMLGPKED RHLAIVLVGL PARGKTFTAA KLTRYLRWLG HDTKHFNVGK YRRLKHGVNM SADFFRADNP 401: EGVEARTEVA ALAMEDMIAW MQEGGQVGIF DATNSTRVRR NMLMKMAEGK CKIIFLETLC NDERIIERNI RLKIQQSPDY SEEMDFEAGV RDFRDRLANY 501: EKVYEPVEEG SYIKMIDMVS GNGGQIQVNN ISGYLPGRIV FFLVNTHLTP RPILLTRHGE SMDNVRGRIG GDSVISDSGK LYAKKLASFV EKRLKSEKAA 601: SIWTSTLQRT NLTASSIVGF PKVQWRALDE INAGVCDGMT YEEVKKNMPE EYESRKKDKL RYRYPRGESY LDVIQRLEPV IIELERQRAP VVVISHQAVL 701: RALYAYFADR PLKEIPQIEM PLHTIIEIQM GVSGVQEKRY KLMD |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)