AT1G02930.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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| FP Images |
Arabidopsis cell culture (peroxisomal marker)
onion epidermal cell layer (peroxisomal marker)
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : glutathione S-transferase 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes glutathione transferase belonging to the phi class of GSTs. Naming convention according to Wagner et al. (2002). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
glutathione S-transferase 6 (GSTF6); FUNCTIONS IN: glutathione transferase activity, copper ion binding, cobalt ion binding, glutathione binding; INVOLVED IN: in 7 processes; LOCATED IN: mitochondrion, cell wall, vacuole, cytoplasm; EXPRESSED IN: fruit, root, cultured cell, leaf; EXPRESSED DURING: seedling growth, seed development stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Thioredoxin fold (InterPro:IPR012335), Glutathione S-transferase, C-terminal (InterPro:IPR004046), Glutathione S-transferase, C-terminal-like (InterPro:IPR010987), Glutathione S-transferase/chloride channel, C-terminal (InterPro:IPR017933), Glutathione S-transferase, N-terminal (InterPro:IPR004045), Thioredoxin-like fold (InterPro:IPR012336); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: glutathione S-transferase 7 (TAIR:AT1G02920.1); Has 11457 Blast hits to 11450 proteins in 1362 species: Archae - 0; Bacteria - 6026; Metazoa - 1625; Fungi - 707; Plants - 1232; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1867 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:661363..662191 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 23487.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 208 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAGIKVFGHP ASTATRRVLI ALHEKNVDFE FVHVELKDGE HKKEPFILRN PFGKVPAFED GDFKIFESRA ITQYIAHEFS DKGNNLLSTG KDMAIIAMGI 101: EIESHEFDPV GSKLVWEQVL KPLYGMTTDK TVVEEEEAKL AKVLDVYEHR LGESKYLASD HFTLVDLHTI PVIQYLLGTP TKKLFDERPH VSAWVADITS 201: RPSAQKVL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)