AT1G02100.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 0.442 golgi 0.318 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Leucine carboxyl methyltransferase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Leucine carboxyl methyltransferase; FUNCTIONS IN: methyltransferase activity; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Leucine carboxyl methyltransferase, LCTM1 1 (InterPro:IPR016651), Leucine carboxyl methyltransferase, eukaryotic (InterPro:IPR021121), Leucine carboxyl methyltransferase (InterPro:IPR007213); Has 605 Blast hits to 597 proteins in 204 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 192; Fungi - 282; Plants - 33; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 98 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:389876..392448 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 37551.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.99 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 332 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAESRSNRAA VQATNDDASA SKLSCVKKGY MKDDYVHLFV KRPVRRSPII NRGYFSRWAA FRKLMSQFLL SGTSSKKQIL SLGAGFDTTY FQLLDEGNGP 101: NLYVELDFKE VTSKKAAVIQ NSSQLRDKLG ANASISIDEG QVLSDHYKLL PVDLRDIPKL RDVISFADMD LSLPTFIIAE CVLIYLDPDS SRAIVNWSSK 201: TFSTAVFFLY EQIHPDDAFG HQMIRNLESR GCALLSIDAS PTLLAKERLF LDNGWQRAVA WDMLKVYGSF VDTQEKRRIE RLELFDEFEE WHMMQEHYCV 301: TYAVNDAMGI FGDFGFTREG GGERMSSSAS SP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)