AT4G38240.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase, putative | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes N-acetyl glucosaminyl transferase I, the first enzyme in the pathway of complex glycan biosynthesis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
COMPLEX GLYCAN LESS 1 (CGL1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycosyl transferase, family 13 (InterPro:IPR004139); Has 453 Blast hits to 453 proteins in 90 species: Archae - 0; Bacteria - 4; Metazoa - 330; Fungi - 0; Plants - 71; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 48 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:17932006..17935209 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 51636.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 444 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MARISCDLRF LLIPAAFMFI YIQMRLFQTQ SQYADRLSSA IESENHCTSQ MRGLIDEVSI KQSRIVALED MKNRQDEELV QLKDLIQTFE KKGIAKLTQG 101: GQMPVAAVVV MACSRADYLE RTVKSVLTYQ TPVASKYPLF ISQDGSDQAV KSKSLSYNQL TYMQHLDFEP VVTERPGELT AYYKIARHYK WALDQLFYKH 201: KFSRVIILED DMEIAPDFFD YFEAAASLMD RDKTIMAASS WNDNGQKQFV HDPYALYRSD FFPGLGWMLK RSTWDELSPK WPKAYWDDWL RLKENHKGRQ 301: FIRPEVCRTY NFGEHGSSLG QFFSQYLEPI KLNDVTVDWK AKDLGYLTEG NYTKYFSGLV RQARPIQGSD LVLKAQNIKD DVRIRYKDQV EFERIAGEFG 401: IFEEWKDGVP RTAYKGVVVF RIQTTRRVFL VGPDSVMQLG IRNS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)