AT1G01420.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.837 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : UDP-glucosyl transferase 72B3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
UDP-glucosyl transferase 72B3 (UGT72B3); FUNCTIONS IN: quercetin 3-O-glucosyltransferase activity, UDP-glycosyltransferase activity, transferase activity, transferring glycosyl groups; INVOLVED IN: metabolic process; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 11 plant structures; EXPRESSED DURING: LP.04 four leaves visible, petal differentiation and expansion stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase (InterPro:IPR002213); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: UDP-Glycosyltransferase superfamily protein (TAIR:AT1G01390.1); Has 7961 Blast hits to 7896 proteins in 480 species: Archae - 0; Bacteria - 474; Metazoa - 2294; Fungi - 32; Plants - 5027; Viruses - 70; Other Eukaryotes - 64 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:154566..156011 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 52787.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.49 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.06 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 481 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MADGNTPHVA IIPSPGIGHL IPLVELAKRL LDNHGFTVTF IIPGDSPPSK AQRSVLNSLP SSIASVFLPP ADLSDVPSTA RIETRISLTV TRSNPALREL 101: FGSLSAEKRL PAVLVVDLFG TDAFDVAAEF HVSPYIFYAS NANVLTFLLH LPKLDETVSC EFRELTEPVI IPGCVPITGK DFVDPCQDRK DESYKWLLHN 201: VKRFKEAEGI LVNSFVDLEP NTIKIVQEPA PDKPPVYLIG PLVNSGSHDA DVNDEYKCLN WLDNQPFGSV LYVSFGSGGT LTFEQFIELA LGLAESGKRF 301: LWVIRSPSGI ASSSYFNPQS RNDPFSFLPQ GFLDRTKEKG LVVGSWAPQA QILTHTSIGG FLTHCGWNSS LESIVNGVPL IAWPLYAEQK MNALLLVDVG 401: AALRARLGED GVVGREEVAR VVKGLIEGEE GNAVRKKMKE LKEGSVRVLR DDGFSTKSLN EVSLKWKAHQ RKIDQEQESF L |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)