AT4G31990.4
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : aspartate aminotransferase 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a plastid-localized aspartate aminotransferase. Does not display any PAT (glutamate/aspartate-prephenate aminotransferase) activity even in the presence of a high concentration of prephenate. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
aspartate aminotransferase 5 (ASP5); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Aminotransferase, class I/classII (InterPro:IPR004839), Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major domain (InterPro:IPR015424), Aminotransferases, class-I, pyridoxal-phosphate-binding site (InterPro:IPR004838), Aspartate/other aminotransferase (InterPro:IPR000796), Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 1 (InterPro:IPR015421); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: aspartate aminotransferase 3 (TAIR:AT5G11520.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:15471074..15473521 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 49327.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.06 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 448 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASLMLSLGS TSLLPREINK DKLKLGTSAS NPFLKAKVLS FLLKPSRFEG ITMAPPDPIL GVSEAFKADT NGMKLNLGVG AYRTEELQPY VLNVVKKAEN 101: LMLERGDNKE YLPIEGLAAF NKATAELLFG AGHPVIKEQR VATIQGLSGT GSLRLAAALI ERYFPGAKVV ISSPTWGNHK NIFNDAKVPW SEYRYYDPKT 201: IGLDFEGMIA DIKEAPEGSF ILLHGCAHNP TGIDPTPEQW VKIADVIQEK NHIPFFDVAY QGFASGSLDE DAASVRLFAE RGMEFFVAQS YSKNLGLYAE 301: RIGAINVVCS SADAATRVKS QLKRIARPMY SNPPVHGARI VANVVGDVTM FSEWKAEMEM MAGRIKTVRQ ELYDSLVSKD KSGKDWSFIL KQIGMFSFTG 401: LNKAQSDNMT DKWHVYMTKD GRISLAGLSL AKCEYLADAI IDSYHNVS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)