AT3G44110.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : DNAJ homologue 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
homologous to the co-chaperon DNAJ protein from E coli | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
DNAJ homologue 3 (ATJ3); FUNCTIONS IN: unfolded protein binding, heat shock protein binding, ATP binding; INVOLVED IN: protein folding, response to salt stress, regulation of ATPase activity; LOCATED IN: nucleolus, cell wall, plasma membrane; EXPRESSED IN: 28 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Molecular chaperone, heat shock protein, Hsp40, DnaJ (InterPro:IPR015609), HSP40/DnaJ peptide-binding (InterPro:IPR008971), Chaperone DnaJ, C-terminal (InterPro:IPR002939), Heat shock protein DnaJ, N-terminal (InterPro:IPR001623), Heat shock protein DnaJ, cysteine-rich domain (InterPro:IPR001305), Heat shock protein DnaJ, conserved site (InterPro:IPR018253), Heat shock protein DnaJ (InterPro:IPR003095), Chaperone DnaJ (InterPro:IPR012724); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: DNAJ homologue 2 (TAIR:AT5G22060.1); Has 26899 Blast hits to 26588 proteins in 3465 species: Archae - 213; Bacteria - 10134; Metazoa - 4292; Fungi - 2434; Plants - 2563; Viruses - 88; Other Eukaryotes - 7175 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:15869115..15871059 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 46446.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.00 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.78 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 420 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MFGRGPSKKS DNTKFYEILG VPKSASPEDL KKAYKKAAIK NHPDKGGDPE KFKELAQAYE VLSDPEKREI YDQYGEDALK EGMGGGGGGH DPFDIFSSFF 101: GGGPFGGNTS RQRRQRRGED VVHPLKVSLE DVYLGTMKKL SLSRNALCSK CNGKGSKSGA SLKCGGCQGS GMKVSIRQLG PGMIQQMQHA CNECKGTGET 201: INDRDRCPQC KGDKVIPEKK VLEVNVEKGM QHSQKITFEG QADEAPDTVT GDIVFVLQQK EHPKFKRKGE DLFVEHTLSL TEALCGFQFV LTHLDGRSLL 301: IKSNPGEVVK PDSYKAISDE GMPIYQRPFM KGKLYIHFTV EFPDSLSPDQ TKALEAVLPK PSTAQLSDME IDECEETTLH DVNIEDEMRR KAQAQREAYD 401: DDDEDDDHPG GAQRVQCAQQ |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)