AT2G36500.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : CBS / octicosapeptide/Phox/Bemp1 (PB1) domains-containing protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
CBS / octicosapeptide/Phox/Bemp1 (PB1) domains-containing protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Octicosapeptide/Phox/Bem1p (InterPro:IPR000270), Cystathionine beta-synthase, core (InterPro:IPR000644); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: CBS / octicosapeptide/Phox/Bemp1 (PB1) domains-containing protein (TAIR:AT3G52950.2); Has 7037 Blast hits to 5620 proteins in 1431 species: Archae - 828; Bacteria - 4978; Metazoa - 7; Fungi - 125; Plants - 270; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 829 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:15318473..15320083 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 58451.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 536 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTTTPTSSGR RSISSIRRTS SASKKPVLQS EESESGSGSI NENTSKPDSP LAQPVSDGER TVKKLRLSKA LTINEGTTVF DACRRMAARR VDAVLLTDSS 101: ALLSGIVTDK DIATRVIAEG LRPEHTLVSK VMTRNPIFVT SDSLAIEALQ KMVQGKFRHL PVVENGEVIA LLDITKCLYD AISRMEKAAE QGSALATAVE 201: ERHWGSGNFA FIDTLRERMF KPALSTIVTE NTKVALVSAS DPVFVASKKM RDLRVNSVII AVGNKIHGIL TSKDILMRVV AQNLSPELTL VEKVMTPNPE 301: CASIETTILD ALHIMHDGKF LHLPVFDKDG FAVACLDVLQ ITHAAISTVE NNSSGAVNDM ANTMMQKFWD SALALEPPED YETHSDMSAM LINSEGKQSC 401: PSQGLVSSFA FKFEDRKGRV QRFNSTGESF EELMSVVMQR CEADSGLQIM YQDDEGDKVL ISRDSDLVAA VTFARSLGQK VLRLHLDFTE TIAPLETIAD 501: LSEGNGGCVW WQTGVLAGAI VLTSIGLFVY LKRSKK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)