AT2G30970.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : aspartate aminotransferase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
ASPARTATE AMINOTRANSFERASE 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
aspartate aminotransferase 1 (ASP1); FUNCTIONS IN: L-aspartate:2-oxoglutarate aminotransferase activity, copper ion binding; INVOLVED IN: response to cadmium ion; LOCATED IN: mitochondrion; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Aminotransferase, class I/classII (InterPro:IPR004839), Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major domain (InterPro:IPR015424), Aminotransferases, class-I, pyridoxal-phosphate-binding site (InterPro:IPR004838), Aspartate/other aminotransferase (InterPro:IPR000796), Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 1 (InterPro:IPR015421); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: aspartate aminotransferase 2 (TAIR:AT5G19550.1); Has 5625 Blast hits to 5619 proteins in 1351 species: Archae - 10; Bacteria - 3742; Metazoa - 486; Fungi - 406; Plants - 379; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 602 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:13179012..13181686 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 47760.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 430 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MALAMMIRNA ASKRGMTPIS GHFGGLRSMS SWWKSVEPAP KDPILGVTEA FLADPSPEKV NVGVGAYRDD NGKPVVLECV REAEKRLAGS TFMEYLPMGG 101: SAKMVDLTLK LAYGDNSEFI KDKRIAAVQT LSGTGACRLF ADFQKRFSPG SQIYIPVPTW SNHHNIWKDA QVPQKTYHYY HPETKGLDFS ALMDDVKNAP 201: EGSFFLLHAC AHNPTGVDPT EEQWREISQL FKAKKHFAFF DMAYQGFASG DPARDAKSIR IFLEDGHHIG ISQSYAKNMG LYGQRVGCLS VLCEDPKQAV 301: AVKSQLQQLA RPMYSNPPLH GAQLVSTILE DPELKSLWLK EVKVMADRII GMRTTLRESL EKLGSPLSWE HVTKQIGMFC YSGLTPEQVD RLTSEYHIYM 401: TRNGRISMAG VTTGNVGYLA NAIHEVTKSS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)