AT1G11840.6
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 0.726 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : glyoxalase I homolog | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a glyoxalase I homolog ATGLX1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
glyoxalase I homolog (GLX1); FUNCTIONS IN: lactoylglutathione lyase activity, metal ion binding; INVOLVED IN: carbohydrate metabolic process; LOCATED IN: peroxisome; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glyoxalase I (InterPro:IPR004361), Glyoxalase I, conserved site (InterPro:IPR018146), Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase (InterPro:IPR004360); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily protein (TAIR:AT1G67280.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:3995928..3997518 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 36293.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 322 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MNEIASASML RLCQCFISIC NVHFVSMRAA ESSFLLSRNM AEASDLLEWP KKDNRRFLHV VYRVGDLDRT IEFYTEVFGM KLLRKRDIPE EKYSNAFLGF 101: GPETSNFVVE LTYNYGVSSY DIGTGFGHFA ISTQDVSKLV ENVRAKGGNV TREPGPVKGG GSVIAFVKDP DGYTFELIQR GPTPEPFCQV MLRVGDLDRA 201: IKFYEKALGM RLLRKIERPE YKYTIGMMGY AEEYESIVLE LTYNYDVTEY TKGNAYAQIA IGTDDVYKSG EVIKIVNQEL GGKITREAGP LPGLGTKIVS 301: FLDPDGWKTV LVDNKDFLKE LE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)