AT5G49810.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : methionine S-methyltransferase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Arabidopsis thaliana methionine S-methyltransferase, an enzyme that catalyzes S -methylmethionine formation. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
methionine S-methyltransferase (MMT); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Aminotransferase, class I/classII (InterPro:IPR004839), Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major domain (InterPro:IPR015424), Methyltransferase small (InterPro:IPR007848), Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 1 (InterPro:IPR015421); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:20239418..20246046 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 118722.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 1071 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
0001: MADLSSVDEF LNQCKQSGDA AYGALRSVLE RLEDPNTRSK ARIFLSDIYK RVGSSETSLQ TYHFHIQDIY LDQYEGFQSR KKLTMMVIPS IFIPEDWSFT 0101: FYEGLNRHPD TIFKDKTVSE LGCGNGWISI AIAAKWLPSK VYGLDINPRA VKISWINLYL NALDDNGEPV YDEEKKTLLD RVEFYESDLL GYCRDNKIQL 0201: ERIVGCIPQI LNPNPEAMSK LITENASEEF LHSLSNYCAL QGFVEDQFGL GLIARAVEEG ISVIKPAGIM IFNMGGRPGQ GVCRRLFERR GVRVTQMWQT 0301: KILQAADTDI SALVEIERSS PHRFEFFMGL SGDQPICART AWAYGKAGGR ISHALSVYSC QIRQPNLVKI IFDFLKNGFQ EISNSLDLSF EDETVADEKI 0401: PFLAYLASVL KNSSYFPFEP PAGSKRFCSL IAGFMRTYHR IPINQDNIVV FPSRAVAIES AFRLFSPRLA IVDEHLTRQL PRSWLTSLAI EDTSMDKSDD 0501: QITVIESPHQ SDLMIELIKK LKPQVVVTGM APFEVITSSS FLHLLEVTKE IGCRLFLDIS DHFELSSLPA SNGVLKYLAE NQLPSHAAII CGLVKNKVYS 0601: DLEVAFVITE VDAIAKALSK TVEVLEGHTA IISQYYYGCL FHELLAFQLA DRHAPAERES EKAKSEEIIG FSSSAVSILK DAELSVTEID ETSLIHMDVD 0701: QSFLQIPQSV KAAIFESFVR QNISEAEVDI NPSIKQFVWS NYGFPTKSST GFVYADGSLA LFNKLVICCA QEGGTLCLPA GTNGNYVAAA KFLKANVVNI 0801: PTESSDGFKL TEKTLTKALE SVKKPWVCIS GPTVSPTGLV YSNEEMDILL STCAKFGAKV IIDTSFSGLE YSATSWDLKN ALSKMDSSLS VSLLGCLSLN 0901: LLSGAIKLGF LVLDQSLIDA FHTLPGLSKP HSTVKYAAKK MLALKEEKAS DFLDAVSETI KTLEGRSRRL KEVLQNSGWE VIQPSAGISM VAKPKAYLNK 1001: KVKLKAGDGQ EIVELTDSNM RDVFLSHTGV CLNSGSWTGI PGYCRFSFAL EDSEFDKAIE SIAQFKSVLA N |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)