AT5G45020.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Glutathione S-transferase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Glutathione S-transferase family protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glutathione S-transferase, predicted (InterPro:IPR016639), Glutathione S-transferase, C-terminal (InterPro:IPR004046), Glutathione S-transferase, C-terminal-like (InterPro:IPR010987), Glutathione S-transferase/chloride channel, C-terminal (InterPro:IPR017933), Thioredoxin-like fold (InterPro:IPR012336); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Glutathione S-transferase family protein (TAIR:AT4G19880.1); Has 2476 Blast hits to 2476 proteins in 820 species: Archae - 30; Bacteria - 1549; Metazoa - 24; Fungi - 237; Plants - 128; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 508 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:18169206..18170488 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 37344.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.53 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 325 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MARSGVDETS ESGAFVRTAS TFRNFVSQDP DSQFPAESGR YHLYISYACP WACRCLSYLK IKGLDEAITF SSVHAIWGRT KETDDHRGWV FPDSDTELPG 101: AEPDYLNGAK SVRELYEIAS PNYEGKYTVP VLWDKKLKTV VNNESSEIIR MFNTEFNGIA KTPSLDLYPS HLRDVINETN GWVFNGINNG VYKCGFARKQ 201: EPYNEAVNQL YEAVDRCEEV LGKQRYICGN TFTEADIRLF VTLIRFDEVY AVHFKCNKRL LREYPNIFNY IKDIYQIHGM SSTVNMEHIK QHYYGSHPTI 301: NPFGIIPHGP NIDYSSPHDR DRFSS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)